Выполнение проекта по теме: «Разработка технологий ранней диагностики клещевого энцефалита, основанных на изменениях экспрессии генов и продукции белков в инфицированных антиген-презентирующих клетках»
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича» (ИБМХ), совместно с Биологическим центром Чешской академии наук выполняет проект в рамках реализации федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014 — 2020 годы» по теме: «Разработка технологий ранней диагностики клещевого энцефалита, основанных на изменениях экспрессии генов и продукции белков в инфицированных антиген-презентирующих клетках», Соглашение о предоставлении субсидии №14.616.21.0094 от 12.02.2018 г. с Минобрнауки России, уникальный идентификатор работ (проекта) RFMEFI61618X0094.
На первом этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:
- Проведён аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы, затрагивающей научно-техническую проблему, исследуемую в рамках проекта.
- Выполнена сравнительная оценка вариантов решения проблемы и обоснование выбора оптимального варианта направления выполнения проекта.
- Проведены патентные исследования в соответствии c ГОСТ Р 15.011-96.
- Выбраны и наработаны модельные клетки для протеомных исследований.
- Экспериментально разработан протокол пробоподготовки для протеомных исследований.
- Разработан протокол протеомного исследования модельных клеток.
- Исследован протеомный профиль модельных клеток.
- Проведена корректировка протокола протеомного исследования модельных клеток по результатам исследования протеомного профиля.
Иностранным партнером проведены следующие работы:
- Выделены антигенпрезентирующие клеток из крови лабораторных животных.
- Выполнена структурно-функциональная характеристика выделенных клеток.
- Осуществлена пробоподготовка антигенпрезентирующих клеток для транскриптомных исследований.
- Экспериментально отработан протокол транскриптомного исследования антигенпрезентирующих клеток: исследован транскриптомный профиль антигенпрезентирующих клеток, выделенных из крови лабораторных животных.
На втором этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:
- Проведена пробоподготовка экспериментальных образцов, полученных из моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита к проведению протеомного исследования.
- Исследован протеомный профиль моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
- Проведена пробоподготовка экспериментальных образцов, полученных из антигенпрезентирующих клеток крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита к проведению протеомного исследования.
- Исследован протеомный профиль антигенпрезентирующих клеток, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
Иностранным партнером проведены следующие работы:
- Выполнено инфицирование моноцитов крови вирусом клещевого энцефалита для проведения транскриптомных и протеомных исследований.
- Произведена наработка и передача экспериментальных образцов, полученных из инфицированных моноцитов крови, соисполнителю со стороны Российской Федерации для проведения протеомных исследований.
- Исследован транскриптомный профиль моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
- Выполнено инфицирование антигенпрезентирующих клеток вирусом клещевого энцефалита для проведения транскриптомных и протеомных исследований.
- Произведена наработка и передача экспериментальных образцов, полученных из инфицированных антигенпрезентирующих клеток, соисполнителю со стороны Российской Федерации для проведения протеомных исследований.
- Исследован транскриптомный профиль антигенпрезентирующих клеток, инфицированных вирусом клещевого энцефалита
На третьем этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:
- верифицированы результаты протеомных исследований в серии биологических повторов;
- разработана спецификация белковых маркеров для ранней диагностики клещевого энцефалита;
- проведена экспериментальная оценка перспективы использования выявленных белковых маркеров для скрининга эффективности кандидатных фармакологических средств: пробоподготовка и проведение протеомных исследований антигенпрезентирующих клеток;
- проведена технико-экономическая оценка результатов проведения исследований;
- выполнено обобщение результатов выполнения проекта, проверено их соответствие требованиям ТЗ, оценена результативность проекта и эффективности результатов в сравнении с современным научно-техническим уровнем.
Иностранным партнером проведены следующие работы:
- разработана спецификация РНК-маркеров для ранней диагностики клещевого энцефалита;
- верифицированы результаты транскриптомных исследований;
- выполнено обобщение и оценка полученных результатов.
Индустриальным партнером проведены следующие работы:
- выполнена экспериментальная оценка перспективы использования выявленных белковых маркеров для скрининга эффективности фармакологических кандидатных средств: наработаны модельные антигенпрезентирующих клеток (далее - контрольные клетки); наработана партия фармакологического кандидатного средства (далее - ЛП) на основе окисленных декстранов; проведена обработка модельных клеток ЛП; осуществлена передача контрольных клеток и клеток, обработанных ЛП, головному исполнителю;
- сформированы предложения по внедрению результатов проведения исследований на базе индустриального партнера.