Выполнение проекта по теме: «Разработка технологий ранней диагностики клещевого энцефалита, основанных на изменениях экспрессии генов и продукции белков в инфицированных антиген-презентирующих клетках»

Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича» (ИБМХ), совместно с Биологическим центром Чешской академии наук выполняет проект в рамках реализации федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014 — 2020 годы» по теме: «Разработка технологий ранней диагностики клещевого энцефалита, основанных на изменениях экспрессии генов и продукции белков в инфицированных антиген-презентирующих клетках», Соглашение о предоставлении субсидии №14.616.21.0094 от 12.02.2018 г. с Минобрнауки России, уникальный идентификатор работ (проекта) RFMEFI61618X0094.

На первом этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:

Проведён аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы, затрагивающей научно-техническую проблему, исследуемую в рамках проекта.
Выполнена сравнительная оценка вариантов решения проблемы и обоснование выбора оптимального варианта направления выполнения проекта.
Проведены патентные исследования в соответствии c ГОСТ Р 15.011-96.
Выбраны и наработаны модельные клетки для протеомных исследований.
Экспериментально разработан протокол пробоподготовки для протеомных исследований.
Разработан протокол протеомного исследования модельных клеток.
Исследован протеомный профиль модельных клеток.
Проведена корректировка протокола протеомного исследования модельных клеток по результатам исследования протеомного профиля.

Иностранным партнером проведены следующие работы:

Выделены антигенпрезентирующие клеток из крови лабораторных животных.
Выполнена структурно-функциональная характеристика выделенных клеток.
Осуществлена пробоподготовка антигенпрезентирующих клеток для транскриптомных исследований.
Экспериментально отработан протокол транскриптомного исследования антигенпрезентирующих клеток: исследован транскриптомный профиль антигенпрезентирующих клеток, выделенных из крови лабораторных животных.

На втором этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:

Проведена пробоподготовка экспериментальных образцов, полученных из моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита к проведению протеомного исследования.
Исследован протеомный профиль моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
Проведена пробоподготовка экспериментальных образцов, полученных из антигенпрезентирующих клеток крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита к проведению протеомного исследования.
Исследован протеомный профиль антигенпрезентирующих клеток, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.

Иностранным партнером проведены следующие работы:

Выполнено инфицирование моноцитов крови вирусом клещевого энцефалита для проведения транскриптомных и протеомных исследований.
Произведена наработка и передача экспериментальных образцов, полученных из инфицированных моноцитов крови, соисполнителю со стороны Российской Федерации для проведения протеомных исследований.
Исследован транскриптомный профиль моноцитов крови, инфицированных вирусом клещевого энцефалита.
Выполнено инфицирование антигенпрезентирующих клеток вирусом клещевого энцефалита для проведения транскриптомных и протеомных исследований.
Произведена наработка и передача экспериментальных образцов, полученных из инфицированных антигенпрезентирующих клеток, соисполнителю со стороны Российской Федерации для проведения протеомных исследований.
Исследован транскриптомный профиль антигенпрезентирующих клеток, инфицированных вирусом клещевого энцефалита

На третьем этапе ИБМХ им. В.Н. Ореховича выполнены следующие работы:

верифицированы результаты протеомных исследований в серии биологических повторов;
разработана спецификация белковых маркеров для ранней диагностики клещевого энцефалита;
проведена экспериментальная оценка перспективы использования выявленных белковых маркеров для скрининга эффективности кандидатных фармакологических средств: пробоподготовка и проведение протеомных исследований антигенпрезентирующих клеток;
проведена технико-экономическая оценка результатов проведения исследований;
выполнено обобщение результатов выполнения проекта, проверено их соответствие требованиям ТЗ, оценена результативность проекта и эффективности результатов в сравнении с современным научно-техническим уровнем.

Иностранным партнером проведены следующие работы:

разработана спецификация РНК-маркеров для ранней диагностики клещевого энцефалита;
верифицированы результаты транскриптомных исследований;
выполнено обобщение и оценка полученных результатов.

Индустриальным партнером проведены следующие работы:

выполнена экспериментальная оценка перспективы использования выявленных белковых маркеров для скрининга эффективности фармакологических кандидатных средств:
сформированы предложения по внедрению результатов проведения исследований на базе индустриального партнера.