Лаборатория нанобиотехнологии

Статистика научной деятельности


О лаборатории

Основным направлением научной деятельности лаборатории является проведение фундаментальных и прикладных работ в протеомике и медицинской диагностике с использованием нанотехнологических устройств. Исследовательские работы проводятся с помощью устройств на основе АСМ (атомно-силового микроскопа), электронного микроскопа, масс-спектрометра, нанопроводного молекулярного детектора и лазерного корреляционного спектрометра.

Метод АСМ предоставляет принципиальную возможность визуализировать и проводить подсчет отдельных белковых макромолекул и их комплексов. С помощью АСМ проводятся следующие исследования биологических объектов (белков, олигонуклеотидов):

  1. АСМ-визуализация единичных молекул и биомолекулярных комплексов.
  2. Разработка фундаментальных основ детекции единичных биомолекул из растоворов аналитов с помощью комбинации методов АСМ и биоспецифического фишинга.
  3. Создание АСМ-наночипов для медицинской протеомики.
  4. Определение физико-химических свойств единичных молекул (single molecule enzymology) с помощью АСМ.
  5. Создание системы сопряжения АСМ и масс-спектрометра для задач медицинской диагностики.

Прикладные направления исследований:

  1. Создание выскочувствительных устройств для медицинской диагностики, в частности атомно-силовых диагностических комплексов с высокочувствительными АСМ-нанобиочипами для диагностики инфекционных и онкологических заболеваний, которые позволяют проводить диагностику заболеваний на уровне единичных молекул. На сегодняшний день существует лабораторный прототип такого устройства. Развитие производства сдерживается в связи с отсутствием медицинского рынка высокотехнологической продукции в этой области. 
  2. Создание высокочувствительных нанопроводных молекулярных детекторов для диагностики инфекционных и онкологических заболеваний заболеваний на уровне единичных вирусных и микробных частиц (совместно с ИФП СО РАН).
  3. Создание наночипов на базе многоканальных нанопроводных молекулярных детекторов для медицинской протеомики (совместно с ИФП СО РАН).

Тел.: +7 (499) xxx-xx-xx

Сотрудники


Проекты

  1. РФФИ 12-04-31570 мол_а (2012-2013гг.) Разработка метода визуализации и идентификации низкокопийных белков на основе комбинации АСМ-фишинга и масс-спектрометрического анализа.
  2. ГК 14.512.11.0018 (2013г.) Разработка мультиплексной тест-системы для выявления многофакторных протеинопатий, лежащих в основе онкологических заболеваний, с помощью АСМ-чипов и масс-спектрометрической идентификации. В рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы».
  3. Грант по заявке № 2012-1.3.1-12-000-2008-013 (Соглашение № 8717 в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы). Разработка метода регистрации и идентификации белков 18-й хромосомы на основе комбинации методов АСМ-химического фишинга и таргетной масс-спектрометрии.
  4. РФФИ 15-04-08368 А (2015-2017 гг.) Высокочувствительная детекция белков c использованием электрокинетических эффектов при АСМ-фишинге.
  5. РНФ 14-25-00132 (2017-2018 гг.). Хромосомоцентричная таргетная протеомика белков плазмы крови человека.
  6. ГК 02.740.11.0791 (2010-2013гг.) Методы формирования высокочувствительных нанопроволочных сенсорных систем на основе нанослоев кремния и изолятора для нового поколения медицинских электронных детекторов (биосенсоров). В рамках ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России».
  7. Разработка фундаментальных основ детекции единичных молекул белка с помощью АСМ и нанопроводных молекулярных детекторов. 2009-2010гг. РФФИ 09-04-12113-офи_м.
  8. Построение молекулярных моделей металлсвязывающих фрагментов природных форм бета-амилоида и разработка методики идентификации низкокопийных белков. 2009-2010гг. ГК 02.512.11.2334.
  9. Выявление и идентификация белков-партнеров цитохром Р4502B4-содержащей монооксигеназной системы в микросомальной фракции с помощью комбинации оптического биосенсора и масс-спектрометра. 2005-2007гг. ГК 05-04-48690-а.

Результаты

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТОК

  1. Методики АСМ-визуализации и детекции единичных биомолекул.
  2. Прототип нанотехнологического комплекса на базе атомно-силовых микроскопов для диагностики гепатитов В и С.
  3. Разработка молекулярных регистрирующих систем для протеомики и на основе АСМ и нанопроводных детекторов.
  4. Методики определения размеров (3 нм – 1 мкм) частиц в растворах, в том числе биологических жидкостях.

Дополнительная информация доступна здесь

Оборудование

  • Атомно-силовые микроскопы NTEGRA (NT-MDT, Россия), Agilent 5500, Nanoscope IVa (Veeco);
  • Сканирующий электронный микроскоп S-5500 Hitachi;
  • Нанопроводной молекулярный детектор (совместно с ИФП СО РАН);
  • Лазерный корреляционный спектрометр N5 (Bruker Coulter);
  • Масс-спеткрометр Autoflex III (Bruker).

Публикации


Журнальные статьи
2019

  1. Pleshakova T.O., Kaysheva A.L., Shumov I.D., Ziborov V.S., Bayzyanova Ja.M., Konev V.A., Uchaikin V.F., Archakov A.I., Ivanov Yu.D., Detection of Hepatitis C Virus Core Protein in Serum Using Aptamer-Functionalized AFM Chips, Micromachines, 2019, 10(2), 129. DOI: 10.3390/mi10020129
  2. Ivanov Yu.D., Kozlov A.F., Galiullin R.A., Tatur V.Yu., Ivanova N.D., Ziborov V.S., Influence of Chip Materials on Charge Generation in Flowing Solution in Nanobiosensors, Applied Sciences (Switzerland), 2019, 9(4), 671. DOI: 10.3390/app9040671
  3. Кайшева А.Л., Копылов А.Т., Кушлинский Н.Е., Герштейн Е.С., Алферов А.А., Морозов А.А., Казанцева И.А., Плешакова Т.О., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д. Сравнительный анализ протеома плазмы крови больных почечно-клеточным раком, Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2019, 167(1), 99-104.

2018

  1. Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Malsagova K.A., Kozlov A.F., Kaysheva A.L., Shumov I.D., Galiullin R.A., Kurbatov L.K., Popov V.P., Naumova O.V., Fomin B.I., Nasimov D.A., Aseev A.L., Alferov A.A., Kushlinsky N.E., Lisitsa A.V., Archakov A.I., Detection of marker miRNAs in plasma using SOI-NW biosensor, Sensors and Actuators: B. Chemical, 2018, 261(1), 566-571. DOI: 10.1016/j.snb.2018.01.153
  2. Pleshakova T.O., Kaysheva A.L., Bayzyanova J.М., Anashkina А.S., Uchaikin V.F., Ziborov V.S., Konev V.A., Archakov A.I., Ivanov Y.D., The detection of hepatitis c virus core antigen using AFM chips with immobolized aptamers, Journal of Virological Methods, 2018, 251, 99-105. DOI: 10.1016/j.jviromet.2017.10.015
  3. Pleshakova T.O., Bukharina N.S., Archakov A.I., Ivanov Yu.D., Atomic Force Microscopy for Protein Detection and Their Physicochemical Characterization, International Journal of Molecular Sciences, 2018, 19(4), 1142. DOI: 10.3390/ijms19041142
  4. Malsagova K.A., Pleshakova T.O., Galiullin R.A., Kaysheva A.L., Shumov I.D., Ilnitskii M.A., Popov V.P., Glukhov A.V., Archakov A.I., Ivanov Yu.D., Ultrasensitive nanowire-based detection of HCVcoreAg in the serum using a microwave generator, Analytical Methods, 2018, 10(1), 2740-2749. DOI: 10.1039/c8ay00495a
  5. Рябцев С.А., Гаспарян Ю.М., Ефимов В.С., Арутюнян З.Р., Поскакалов А.Г., Писарев А.А., Канашенко С.Л., Иванов Ю.Д., Влияние исходной дефектной структуры на захват гелия в вольфрам при ионном внедрении, Ядерная физика и инжиниринг, 2018, 9(1), 21-27. DOI: 10.1134/S2079562917060215
  6. Кайшева А.Л., Копылов А.Т., Кушлинский Н.Е., Алферов А.А., Плешакова Т.О., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Панорамная масс-спектрометрия: поиск кандидатных белковых маркеров рака яичников в плазме крови, Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии, 2018, 17(3), 5-13. DOI: 10.20953/1726-1678-2018-3-5-13
  7. Кайшева А.Л., Копылов А.Т., Плешакова Т.О., Кушлинский Н.Е., Никитаев В.Г., Дружинина Е.А., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Масс-спектрометрическое профилирование белкового состава плазмы крови больных раком толстого кишечника, Краткие сообщения по физике Физического института им. П.Н. Лебедева Российской Академии Наук, 2018, 45(9), 34-38 (Kaysheva A.L., Kopylov A.T., Pleshakova T.O., Kushlinskii N.E., Nikitaev V.G., Druzhinina E.A., Archakov A.I., Ivanov Y.D., Mass Spectrometry Profiling of the Protein Composition of Blood Plasma of Colorectal Cancer Patients, Bulletin of the Lebedev Physics Institute, 2018, 45(9), 279-281. DOI: 10.3103/S1068335618090051)
  8. Иванов Ю.Д., Козлов А.Ф., Галиуллин Р.А., Татур В.Ю., Зиборов В.С., Иванова Н.Д., Никитаев В.Г., Дружинина Е.А., Плешакова Т.О., Влияние импульсного электрического поля на генерацию заряда в проточных медицинских и диагностических системах, Медицинская техника, 2018, 52(4), 10-12 (Ivanov Y.D., Kozlov A.F., Galiullin R.A., Tatur V.Yu., Ziborov V.S., Ivanova N.D., Nikitaev V.G., Druzhinina E.A., Pleshakova T.O., The Effect of Pulsed Electric Field on the Generation of Charge in Flow-Based Medical and Diagnostic Systems, Biomedical Engineering, 2018, 52(4), 231-234. DOI: 10.1007/s10527-018-9819-7).
  9. Ivanov Yu.D., Malsagova K.A., Pleshakova T.O., Galiullin R.A., Kozlov A.F., Shumov I.D., Ivanova I.A., Archakov A.I., Popov V.P., Latyshev A.V., Rudenko K.V., Glukhov A.V., Ultrasensitive Detection of 2,4-Dinitrophenol Using Nanowire Biosensor, Journal of Nanotechnology, 2018, 2018(1), 9549853. DOI: 10.1155/2018/9549853
  10. Ivanov Yu., Kozlov A.F., Galiullin R.A., Tatur V.Y., Ziborov V.S., Ivanova N.D., Pleshakova T.O., Vesnin S.G., Goryanin I., Use of Microwave Radiometry to Monitor Thermal Denaturation of Albumin, Frontiers in Physiology, 2018, 9(1), 956. DOI: 10.3389/fphys.2018.00956
  11. Ivanov Yu.D., Kozlov A.F., Galiullin R.A., Tatur V.Yu., Ziborov V.S., Usanov S.A., Pleshakova T.O., Influence of a Pulsed Electric Field on Charge Generation in a Flowing Protein Solution, Separations, 2018, 5(2), 29. DOI: 10.3390/separations5020029
  12. Malsagova K.A., Pleshakova T.O., Kozlov A.F., Shumov I.D., Ilnitskii M.A., Miakonkikh A.V., Popov V.P., Rudenko K.V., Glukhov A.V., Kupriyanov I.N., Ivanova N.D., Rogozhin A.E., Archakov A.I., Ivanov Yu.D., Micro-Raman Spectroscopy for Monitoring of Deposition Quality of High-k Stack Protective Layer onto Nanowire FET Chips for Highly Sensitive miRNA Detection, Biosensors, 2018, 8(3), 72. DOI: 10.3390/bios8030072
  13. Ivanov Yu.D., Kozlov A.F., Galiullin R.A., Kanashenko S.L., Usanov S.A., Ivanova N.D., Ziborov V.S., Pleshakova T.O., Spontaneous generation of charge in the flow-based AFM fishing system, Journal of Electrostatics, 2018, 91C(1), 16-20. DOI: 10.1016/j.elstat.2017.11.003
  14. Shumov I.D.,Kanashenko S.L. , Ziborov V.S., Ivanov Y.D., Archakov A.I., Pleshakova T.O., The limit of mass determination with an AFM cantilever-based system, IOP Conference Series: Materials Science and Engineering, 2018, 443(1), 12032. DOI: 10.1088/1757-899X/443/1/012032
  15. Ivanov Y.D., Kozlov A.F., Galiullin R.A., Tatur V.Y., Ivanova N.D., Ziborov V.S., Influence of AC electric field on the charge generation in albumin solution in a flow-based AFM fishing system, IOP Conference Series: Materials Science and Engineering, 2018, 443(1), 12011. DOI: 10.1088/1757-899X/443/1/012011
  16. Shumov I.D., Kanashenko S.L., Ziborov V.S., Ivanov Yu.D., Archakov A.I., Pleshakova T.O., Magnetron sputtering deposition of ultra-thin metal coatings for the visualization of protein-containing objects of nanometer size by electron microscopy, Journal of Physics: Conference Series, 2018, 1058(1), 12048. DOI: 10.1088/1742-6596/1058/1/012048

2017

  1. Ivanov Yu.D., Kozlov A.F.,Galiullin R.A. , Kolesanova E.F., Pleshakova T.O., Spontaneous Charge Generation in Flowing Albumin Solutions at 35 C and 38 C, Biosensors, 2017, 7(1), 60-60. DOI: 10.3390/bios7040060
  2. Kaysheva A.L., Pleshakova T.O., Kopylov A.T., Shumov I.D., Iourov I.Y., Vorsanova S.G., Yurov Y.B., Ziborov V.S., Archakov A.I., Ivanov Y.D., Combination of atomic force microscopy and mass spectrometry for the detection of target protein in the serum samples of children with autism spectrum disorders, IOP Conference Series: Materials Science and Engineering, 2017, 256(1), 12015-12015. DOI: 10.1088/1757-899X/256/1/012015
  3. Kaysheva A.L., Kopylov A.T., Pleshakova T.O., I.Y. Iourov, S.G. Vorsanova, Yu.B. Yurov, A.A. Shchetkin, A.I. Archakov, Yu.D. Ivanov, Proteomic analysis of serum proteins of children with autism, Biotecnologia Aplicada, 2017, 34(1), 2211-2214.
  4. Шумов И.Д., Канашенко С.Л., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Магнетронное напыление металлов на биологические объекты нанометрового размера на примере вируса табачной мозаики, Прикладная физика, 2017, 2017(4), 10-15.
  5. Khramova T.V., Kaysheva A.L., Ivanov Y.D., Pleshakova T.O., Iourov I.Y., Vorsanova S.G., Yurov Y.B., Schetkin A.A., Archakov A.I., Serologic Markers of Autism Spectrum Disorder, Journal of Molecular Neuroscience, 2017, 62(3-4), 420-429. DOI: 10.1007/s12031-017-0950-9
  6. Pleshakova T.O., Malsagova K.A., Kaysheva A.L., Kopylov A.T., Tatur V.Yu., Ziborov V.S., Kanashenko S. L., Galiullin R.A., Ivanov Yu.D., Highly sensitive protein detection by biospecific AFM-based fishing with pulsed electrical stimulation, FEBS Open Bio, 2017, 7(8), 1186-1195. DOI: 10.1002/2211-5463.12253
  7. Shumov I.D., Kanashenko S.L., Ziborov V.S., Ivanov Yu.D., Archakov A.I., Pleshakova T.O., Formation of sensor array on the AFM chip surface by magnetron sputtering, Journal of Physics: Conference Series, 2017, 789, 12053. DOI: 10.1088/1742-6596/789/1/012053
  8. Мальсагова К.А., Плешакова Т.О., Галиуллин Р.А., Шумов И.Д., Ильницкий М.А., Глухов А.В., Попов В.П., Асеев А.Л., Конев В.А., Учайкин В.Ф., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Нанопроводный биосенсор p-типа с иммобилизованными антителами для высокочувствительной регистрации молекул HCVcoreAg – белкового маркера вирусного гепатита С, Патогенез, 2017, 15(3), 50-57.
  9. Храмова Т.В., Кайшева А.Л., Плешакова Т.О., Юров И.Ю., Ворсанова С.Г., Юров Ю.Б., Щеткин А.А., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Расстройства аутистического спектра. Прогностические и диагностические факторы, Вопросы практической педиатрии, 2017, 12(5), 35-43. DOI: 10.20953/1817-7646-2017-5-35-43
  10. Bukharina N.S., Pleshakova T.O., Ziborov V.S., Fokin D.A., Ivanova N.D., Ivanov Yu.D., Atomic Force Microscopy Analysis of Deformation of Single Cytochrome CYP102A1 Molecules, Science of Advanced Materials, 2017, 9(1), 135-143. DOI: 10.1166/sam.2017.2947
  11. Иванов Ю.Д., Козлов А.Ф., Галиуллин Р.А., Татур В.Ю., Веснин С.Г., Зиборов В.С., Иванова Н.Д., Плешакова Т.О., Мониторинг флуктуаций яркостной температуры воды в СВЧ-диапазоне, Патологическая физиология и экспериментальная терапия, 2017, 61(2), 101-107.
  12. Иванов Ю.Д., Козлов А.Ф., Галиуллин Р.А., Иванова Н.Д., Татур В.Ю., Зиборов В.С., Юшков Е.С., Плешакова Т.О., Генерация и аккумуляция заряда в проточной системе для выявления белковых маркеров заболеваний, Патологическая физиология и экспериментальная терапия, 2017, 61(4), 167-175.
  13. Pleshakova T.O., Kaysheva A.L., Bayzyanova J.M., Anashkina A.S., Uchaikin V.F., Shumov I.D., Ziborov V.S., Konev V.A., Archakov A.I., Ivanov Y.D., Advantages of aptamers as ligands upon protein detection by AFM-based fishing, Analytical Methods, 2017, 9(42), 6049-6060. DOI: 10.1039/c7ay01216k

2016

  1. Плешакова Т.О., Мальсагова К.А., Козлов А.Ф., Канашенко С.Л., Иванова Н.Д., Садовская Т.А., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Высокочувствительный АСМ-фишинг альбумина, Патогенез, 2016, 3, 30-36.
  2. Кайшева А.Л., Копылов А.Т., Юров И.Ю., Ворсанова С.Г., Юров Ю.Б., Галиуллин Р.А., Анашкина А.С., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Протеомный анализ белкового профиля сывороток крови больных аутизмом детей, Вопросы практической педиатрии, 2016, 11(5), 12-17. DOI: 10.20953/1817-7646-2016-5-12-17
  3. Ivanov Y.D., Kozlov A.F., Mаlsagovа К.А., Pleshakova T.O., Vesnin S.G., Tatur V.Yu., Ivanova N.D., Ziborov V.S., Monitoring of microwave emission of HRP system during the enzyme functioning, Biochemistry and Biophysics Reports, 2016, 7, 20-25. DOI: 10.1016/j.bbrep.2016.05.003
  4. Ivanov Y.D., Mаlsagovа К.А., Izotov A.A., Pleshakova T.O., Tatur V.Yu., Vesnin S.G., Ivanova N.D., Usanov S.A., Archakov A.I., Detection of microwave radiation of cytochrome CYP102 A1 solution during the enzyme reaction, Biochemistry and Biophysics Reports, 2016, 5, 285-289. DOI: 10.1016/j.bbrep.2015.12.013
  5. Kaysheva A.L., Ivanov Y.D., Frantsuzov P.A., Krohin N.V., Pavlova T.I., Uchaikin V.F., Konev V.A., Kovalev O.B., Ziborov V.S., Archakov A.I., Mass spectrometric detection of the amino acid sequence polymorphism of the hepatitis C virus antigen, Journal of Virological Methods, 2016, 229, 86-90. DOI: 10.1016/j.jviromet.2015.12.012
  6. Иванов Ю.Д., Мальсагова К.А., Татур В.Ю., Веснин С.Г., Иванова Н.Д., Зиборов В.С., СВЧ-излучение раствора альбумина при внешнем возбуждении, Патологическая физиология и экспериментальная терапия, 2016, 60(3), 101-104.
  7. Иванов Ю.Д., Мальсагова К.А., Плешакова Т.О., Шумов И.Д., Кайшева А.Л., Попов В.П., Наумова О.В., Фомин Б.И., Насимов Д.А., Латышев А.В., Асеев А.Л., Татур В.Ю., Иванова Н.Д., Коновалова Г.М., Арчаков А.И. , Регистрация белка в сыворотке крови с помощью биосенсора на базе полевого нанотранзистора, Патологическая физиология и экспериментальная терапия, 2016, 60(1), 94-98.
  8. Иванов Ю.Д., Мальсагова К.А., Плешакова Т.О., Веснин С.Г., Татур В.Ю., Ярыгин К.Н., Мониторинг яркостной температуры суспензии клеток фолликулярной карциномы щитовидной железы в СВЧ-диапазоне с помощью радиотермометрии, Патологическая физиология и экспериментальная терапия, 2016, 60(4), 174-177.
  9. Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Мальсагова К.А., Кайшева А.Л., Копылов А.Т., Изотов А.А., Татур В.Ю., Веснин С.Г., Иванова Н.Д., Зиборов В.С., Арчаков А.И., АСМ-фишинг белка в импульсном электрическом поле, Биомедицинская химия, 2016, 62(4), 439-446, DOI: 10.18097/PBMC20166204439 (Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Malsagova K.A., Kaysheva A.L., Kopylov A.T., Izotov A.A., Tatur V.Yu., Vesnin S.G., Ivanova N.D., Ziborov V.S., Archakov A.I., AFM-based protein fishing in the pulsed electric field, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, 9(2), 121-129)
  10. Кайшева А.Л., Иванов Ю.Д., Французов П.А., Учайкин В.Ф., Конев В.А., Арчаков А.И., Масс-спектрометрическое определение изотипа кор-антигена вируса гепатита C, Инфекционные болезни, 2016, 14(4), 51-55. DOI: 10.20953/1729-9225-2016-4-51-55
  11. Шумов И.Д., Плешакова Т.О., Канашенко С.Л., Зиборов В.С., Иванов Ю.Д., Использование магнетронного напыления для маркирования поверхности АСМ-чипов, Вестник Дагестанского государственного университета. Серия 1: Естественные науки, 2016, 31(4), 57-63. DOI: 10.21779/2542-0321-2016-31-4-57-63
  12. Voeikova T.A., Shebanova A.S., Ivanov Yu.D., Kaysheva A.L., Novikova L.M., Zhuravliova O.A., Shumyantseva V.V., Shaitan K.V., Kirpichnikov M.P., Debabov V.G., The role of proteins of the outer membrane of Shewanella oneidensis MR-1 in the formation and stabilization of silver sulfide nanoparticles, Applied Biochemistry and Microbiology, 2016, 52(8), 769-775. DOI: 10.1134/S0003683816080081

2015

  1. Бухарина Н.С., Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Французов П.А., Иванова Н.Д., Крохин Н.В., Петушкова Н.А., Арчаков А.И., АCМ-исследование зависимости олигомерного состояния цитохрома BM3 от температуры, Биофизика, 2015, 80(1), 80-87 (Bukharina N.S., Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Frantsuzov P.A., Ivanova N.D., Krohin N.V., Petushkova N.A., Archakov A.I., Atomic Force Microscopy Monitoring of Temperature Dependence of Cytochrome BM3 Oligomeric State, Biophysics, 2015, 80(1), 66-72. DOI: 10.1134/S000635091501008X)
  2. Плешакова Т.О., Шумов И.Д., Иванов Ю.Д., Мальсагова К.А., Кайшева А.Л., Арчаков А.И., АCM-технологии как путь к обратному числу Авогадро, Биомедицинская химия, 2015, 61(2), 239-253. DOI: 10.18097/PBMC20156102239 (Pleshakova T.O., Shumov I.D., Ivanov Yu.D., Malsagova K.A., Kaysheva A.L., Archakov A.I., AFM-Based Technologies as the Way Towards the Reverse Avogadro Number, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, 9(3), 244-257. DOI: 10.1134/S1990750815030063).
  3. Бухарина Н.С., Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Французов П.А., Андреева Е.Ю., Кайшева А.Л., Изотов А.А., Павлова Т.И., Зиборов В.С., Радько С.П., Арчаков А.И., АСМ-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация, Биомедицинская химия, 2015, 61(3), 363-372. DOI: 10.18097/PBMC20156103363.
  4. Мальсагова К.А., Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Козлов А.Ф., Крохин Н.В., Кайшева А.Л., Шумов И.Д., Попов В.П., Наумова О.В., Фомин Б.И., Насимов Д.А., КНИ-нанопроволочный биосенсор для детекции белка D-NFAT 1, Биомедицинская химия, 2015, 61(4), 462-467. DOI: 10.18097/PBMC20156104462
  5. Mаlsagovа К.А., Ivanov Y.D., Pleshakova T.O., Kaysheva A.L., Shumov I.D., Kozlov A.F., Archakov A.I., Popov V.P., Fomin B.I., Latyshev A.V., A SOI-nanowire biosensor for the multiple detection of D-NFATc1 protein in the serum, Analytical Methods, 2015, 7(19), 8078-8085. DOI: 10.1039/C5AY01866H
  6. Иванов Ю.Д., Мальсагова К.А., Татур В.Ю., Веснин С.Г., Иванова Н.Д., Зиборов В.С., СВЧ-излучение воды в аналитических системах, Патологическая физиология и экспериментальная терапия, 2015, 59(4), 78-81.
  7. Ivanov Y.D., Kaysheva A.L., Frantsuzov P.A., Pleshakova T.O., Krohin N.V., Izotov A.A., Shumov I.D., Uchaikin V.F., Konev V.A., Ziborov V.S., Archakov A.I., Detection of hepatitis C virus core protein in serum by atomic force microscopy combined with mass spectrometry, International Journal of Nanomedicine, 2015, 10, 1597-1608. DOI: 10.2147/IJN.S71776

2014

  1. Иванов Ю.Д., Даничев В.В., Плешакова Т.О., Шумов И.Д., Зиборов В.С., Крохин Н.В., Загуменный М.Н., Устинов В.С., Смирнов Л.П., Широнин А.В., Арчаков А.И., Химический необратимый фишинг низкокопийных белков, Биомедицинская химия, 2014, том:60(1), стр:28-50. (Ivanov Yu.D., Danichev V.V., Pleshakova T.O., Shumov I.D., Ziborov V.S., Krokhin N.V., Zagumenniy M.N., Ustinov V.S., Smirnov L.P., Archakov A.I. Irreversible chemical AFM-based fishing for the detection of low-copied proteins. Biochemistry (Moscow) Suppl. Series B: Biomedical Chemistry. – 2013. – V. 7. – Issue 1. – P. 46-61. DOI: 10.1134/S1990750813010071)
  2. Bukharina N. S., Yu. D. Ivanov, T. O. Pleshakova, P. A. Frantsuzov, E. Yu. Andreeva, A. L. Kaysheva, A. A. Izotov, T. I. Pavlova, V. S. Ziborov, S. P. Radko, and A. I. Archakov, Atomic force microscopy fishing of gp120 on immobilized aptamers and its mass spectrometry identification, Bioсhemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2014, vol:8(2), pages:115-124.
  3. Маlsagovа К.А., Ivanov Y.D., Pleshakova T.O., Kozlov A.F., Krokhin N.V., Kaysheva A.L., Shumov I.D., Popov V.P., Naumova O.V., Fomin B.I., Nasimov D.A. SOI-nanowire biosensor for detection of D-NFATc1 protein, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2014, vol:8(3), pages:220-225.
  4. Ivanov Y.D., Pleshakova T., Маlsagovа К., Kozlov A., Kaysheva A., Kopylov A., Izotov A., Andreeva E., Kanashenko S., Usanov S., Archakov A. Highly sensitive protein detection by combination of atomic force microscopy fishing with charge generation and mass spectrometry analysis, The FEBS Journal, 2014, vol:281(20), pages:4705-4717.
  5. Ivanov Y.D., Bukharina N.S., Pleshakova T.O., Frantsuzov P.A., Andreeva E.Yu., Kaysheva A.L., Zgoda V.G., Izotov A.A., Pavlova T.I., Ziborov V.S., Radko S.P., Moshkovskii S.A., Archakov A.I. Atomic force microscopy fishing and mass spectrometry identification of gp120 on immobilized aptamers, International Journal of Nanomedicine, 2014, vol:9, pages:4659-4670.
  6. Ivanov Y.D., Kaysheva A.L., Frantsuzov P.A., Pleshakova T.O., Krohin N.V., Izotov A.A., Shumov I.D., Uchaikin V.F., Konev V.A., Ziborov V.S., Archakov A.I. Detection of hepatitis C virus core protein in serum by atomic force microscopy combined with mass spectrometry, International Journal of Nanomedicine, 2014, In press.
  7. Yuri D. Ivanov, Tatyana O. Pleshakova, Vladimir P. Popov,Olga V. Naumova, Alexander L. Aseev and Alexander I. Archakov. SOI-Nanowire Biosensors for High-Sensitivity Protein and Gene Detection. In: Functional Nanomaterials and Devices for Electronics, Sensors and Energy Harvesting. A. Nazarov, F. Balestra, V. Kilchytska, D. Flandre (Eds.) Springer International Publishing Switzerland. (2014). pp. 445-467. DOI: 10.1007/978-3-319-08804-4_20

2013

  1. Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Козлов А.Ф., Мальсагова К.А., Крохин Н.В., Кайшева А.Л., Шумов И.Д., Попов В.П., Наумова О.В., Фомин Б.И., Насимов Д.А., Асеев А.Л., Арчаков А.И. КНИ-нанопроволочный транзистор для детекции молекул D-NFATc1. Автометрия. – 2013. – Т. 49. – Вып. 5. – С.119-126. (Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Kozlov A.F., Маl’sagovа К.А., Krohin N.V., Kaшsheva A.L., Shumov I.D., Popov V.P., Naumova O.V., Fomin B.I., Nasimov D.A., Aseev A.L., Archakov A.I. SOI nanowire transistor for detection of D-NFATc1 molecules. Optoelectronics, Instrumentation and Data Processing. – 2013. – V. 49. – Issue 5. – P. 520-525).
  2. Ivanov Yu.D., Pleshakova T.O., Krohin N.V., Kaysheva A.L., Usanov S.A., Archakov A.I. Registration of the protein with compact disc. Biosensors and Bioelectronics. 2013. V. 43. P. 384-390.

2012

  1. Yu. D. Ivanov, N. S. Bukharina, P. A. Frantsuzov, T. O. Pleshakova, N. V. Krohin, S. L. Kanashenko, A. I. Archakov. Oligomeric State Investigation of Flavocytochrome CYP102A1 using AFM with Standard and Supersharp Probes. Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2012. V. 6. Issue 3. P: 218-224.
  2. Y. D. Ivanov, T. O. Pleshakova, A. F. Kozlov, K. A. Malsagova, N. V. Krohin, V. V. Shumyantseva, I. D. Shumov, V. P. Popov, O. V. Naumova, B. I. Fomin, D. A. Nasimov, A. L. Aseev, A. I. Archakov. SOI nanowire for the high-sensitive detection of HBsAg and a-fetoprotein. Lab on a Chip. 2012. V. 12. Issue 23. P. 5104-5111.
  3. Y. D. Ivanov, N. S. Bukharina, P. A. Frantsuzov, T. O. Pleshakova, S. L. Kanashenko, N. V. Medvedeva, V. V. Argentova, V. G. Zgoda, A. W. Munro, A. I. Archakov. AFM study of cytochrome CYP102A1 oligomeric state. Soft Matter. 2012. V. 8. Issue 17. P. 4602-4608.

2011

  1. Y.D. Ivanov, P.A. Frantsuzov, A. Zöllner, N.V. Medvedeva, A.I. Archakov, W. Reinle, R. Bernhardt. Atomic Force Microscopy Study of Protein–Protein Interactions in the Cytochrome CYP11A1 (P450scc)-Containing Steroid Hydroxylase System. Nanoscale Research Letters. 2011, V. 6, P. 54. doi:10.1007/s11671-010-9809-5.
  2. А.Л. Кайшева, Ю.Д. Иванов, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, Н.В. Крохин, В.С. Зиборов, В.А. Конев, О.Б. Ковалев, А.И. Арчаков. Регистрация и идентификация НСVcore-содержащих вирусных частиц гепатита С с помощью комбинации атомно-силовой микроскопии и масс-спектрометрии. Нанотехнологии и охрана здоровья. 2011. Т. 3. С. 28-34.
  3. Ю.Д. Иванов, Н.С. Бухарина, Т.О. Плешакова, П.А. Французов, Н.В. Крохин, В.С. Зиборов, А.И. Арчаков. АСМ-визуализация, измерение активности и физико-химических свойств единичных мономеров и олигомеров ферментов. Биофизика. 2011. Т. 56. Вып. 5. С. 939-944.
  4. V. P. Popov, O. V. Naumova, Yu. D. Ivanov Semiconductor-on-insulator materials for nanoelectronics applications. Semiconductor-On-Insulator Materials For Nanoelectronics Applications. 2011. V. 4. P. 343-353.
  5. Archakov A.I. and Ivanov Yu.D. Application of AFM and optical biosensor for investigation of complexes formed in P450-containing monooxygenase systems. Biochimica et Biophysica Acta – Proteins and Proteomics, 2011, 1814, 102-110.

2010

  1. Yuri D. Ivanov, Pavel A. Frantsuzov, A. V. Ivanov, Victor A. Bykov, S. Besedin, Hui Bon Hoa, Alexander I. Archakov. Comparative investigation of PdR by usual and ultrafine atomic force microscopy Anal. Methods, 2010, 2, 688 – 693.
  2. АСН-нанотехнологии для визуализации, счета, определения упругости и активности единичных белков цитохром P450-содержащих монооксигеназных систем / Ю. Д. Иванов, Н.С. Бухарина, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, А.В. Мунро, Г. Хуэй Бон Хоа, А.И. Арчаков Нанотехнологии и охрана здоровья. 2010. Т. 1. Вып. 2. С. 30-35.
  3. В.С. Зиборов, А.Л. Кайшева, Ю.Д. Иванов, В.Г. Згода, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, Н.В. Крохин, А.И. Арчаков. Визуализация и идентификация вирусных частиц гепатита C при помощи атомно-силовой микроскопии, сопряженной с МС/МС анализом. Биомедицинская химия. 2010. Т. 56. Вып. 1. С. 26-39.
  4. А.В. Иванов, А.Т. Копылов, В.Г. Згода, И.Ю. Торопыгин, Е.В. Хряпова, Ю.Д. Иванов. Масс-спектрометрическая идентификация сайтов взаимодействия цитохрома P450 2В4 с NADPH:цитохром р450 редуктазой. Биомедицинская химия. 2010. Т. 56. Вып. 1. С. 40-54.
  5. O. V. Naumova, B. I. Fomin, D. A. Nasimov, N.V. Dudchenko, S.F. Devyatova, E.D. Zhanaev, V. P. Popov, A. V. Latyshev, A. L. Aseev, Yu. D. Ivanov, A. I. Archakov. SOI nanowires as sensors for charge detection. Semiconductor Science and Technology. 2010. V. 25. Issue 5. P. 055004.

2009

  1. Иванов Ю.Д., Иванов А.В., Кайшева А.Л., Згода В.Г., Уи Бон Уа Г., Усанов С.А., Арчаков А.И. Продуктивные и непродуктивные комплесы в цитохром P450-содержащих системах. Биомедицинская химия 2009, 55, 3, .310-330. (Productive and non-productive complexes in cytochrome p450-containing systems / Yu. D. Ivanov, A.V. Ivanov, A. L. Kaysheva, V. G. Zgoda, A. I. Archakov, S. A. Usanov, G. Hui-Bon-Hoa // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2009. V. 3. P. 183-197.)
  2. Archakov A.I., Ivanov Y.D., Lisitsa A.V., Zgoda V.G. Biospecific irreversible fishing coupled with atomic force microscopy for detection of extremely low-abundant proteins. Proteomics. 2009, 9, 5, 1326-1343.
  3. Ю.Д. Иванов, П.А. Французов, Т.О. Плешакова, В.С Зиборов, С.К. Светлов, Н.В. Крохин, В.А. Конев, О.Б. Ковалев, В.Ф. Учайкин, О.Н. Ястребова, П. Г. Свешников, А.И. Арчаков. Детекция серологических маркеров вирусных гепатитов В и С методом атомно-силовой микроскопии.// Биомедицинская химия, 2009, 55 689-701, Yu.D. Ivanov, P.A.Frantsuzov, T.O. Pleshakova ,V.S. Ziborov, S.K. Svetlov, N.I. Krohin. V.A. Konev, O.B. Kovalev, V.F. Uchaikin, O.N. Yastrebova, P.G. Sveshnikov, A.I. Archakov. Atomic Force Microscopy of Serological Markers of Viral Hepatites B and C. Biomeditsinkaya Khimiya, 55 (2009) 689-701
  4. O. V. Naumova, V. P. Popov, L. N. Safronov, B. I. Fomin, D. A. Nasimov, A. V. Latysheva, A. L. Aseev, Yu. D. Ivanov and A. I. Archakov. Ultra-Thin SOI Layer Nanostructuring and Nanowire Transistor Formation for FemtoMole Electronic Biosensors. ECS Transactions, 25 (10) 83-87 (2009) 10.1149/1.3241580

2008

  1. Иванов Ю.Д., Иванов А.В., Петушкова Н.А., Гара О.Г.. Кузнецов В.Ю., Подоплелов А.В., Арчаков А.И. Оптико-биосенсорный анализ взаимодействий редокс-партнеров цитохром Р450 2В4 – содержащей монооксидазной системы в условиях гидроксилирования. Биомедицинская химия, 2008, 54, 435-444. (The optical biosensor study of the redox partner interaction with the cytochrome p450 2b4-containing monooxygenase system under hydroxylation conditions / Yu. D. Ivanov, A. V. Ivanov, N. A. Petushkova, O. G. Gara, V. Yu. Kuznetsov, A. V. Podoplelov, A. I. Archakov // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. 2008. V. 2. Issue 4. P. 367-372.)

2007

  1. Archakov A.I., Ivanov Yu.D. Analytical nanobiotechnology for medicine diagnostics. Molecular Biosystems, 2007, 3, 336-342.
  2. Medvedeva N.V., Ipatova O.P., Ivanov Yu.D., Drozhzhin A.I. and Archakov A.I. Nanobiotechnology and Nanomedicine. Biomedical Chemistry, 2007, 1, 2, 114-124.
  3. Archakov A.I., Ivanov Y.D., Lisitsa A.V., Zgoda V.G. AFM fishing nanotechnology is the way to reverse the Avogadro number in proteomics. Proteomics, 2007, 7, 4–9.

2006

  1. Medvedev A., Buneeva O., Gnedenko O., Fedchenko V., Medvedeva M., Ivanov Y., Glover V., Sandler M. Isotin interaction with glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, a putative target of neuroprotective drugs: partial agonism with deprenyl. J. Neural Transm, 2006, 71, 97-103.
  2. Ivanov Yu.D., Govorun V.M., Bykov V.A. and Archakov A.I. Nanotechnology in Proteomics, Proteomics, 2006, 6, 1399-1414.
  3. Медведева Н. В., Ипатова О.М., Иванов Ю.Д., Дрожжин А.И., Арчаков А.И. Нанобиотехнология и наномедицина, Биомедицинская химия, 2006, 52, 6, 529-546.
  4. Арчаков А.И., Иванов Ю.Д. Аналитические нанотехнологии в диагностической протеомике. Сборник материалов XIX(82) сессии общего собрания Российской Академии Медицинских Наук,.
  5. Иванов Ю.Д., Учайкин В.Ф., Плешакова Т.О., Французов П.А., Светлов С.К., Конев В.А., Ковалев О.Б., Ястребова О.Н., Свешников П.Г., Уланова Т.И., Арчаков А.И. Создание нового поколения био-и иммуносенсоров и биочипов для диагностики инфекционных и неинфекционных заболеваний. Физиология и патология иммунной системы, 2006, 12, 10, 11-14.

2005

  1. Раченкова Н.И., Иванов Ю.Д., Скворцов В.С., Иванов А.С., Молнар А.А., Уи Бон Уа Г., Арчаков А.И. Исследование взаимодействия цитохромов b5 с Р450CAM с помощью метода оптического биосенсора и компьютерного моделирования. Биомедицинская химия, 2005, 51, 501-512.
  2. Archakov A.I., Inanov Yu.D. Nano(Bio)Technology for Medicine in Russia. Proceedings of EuroNanoForum 2005 (Nanotechnology and the Health of the EU Citizen in 2020), 201-208.
  3. Раченкова Н.И., Иванов Ю.Д., Мольнар А.А., Арчаков А.И. Исследования взаимодействия трипсина с соевым ингибитором трипсина с помощью метода оптического биосенсора. Биомедицинская химия, 2005, 51, 6, 614-623.

2004

  1. Kuznetsov V.Yu., Ivanov Yu.D., Archakov A.I. Atomic force microscopy revelation of molecular complexes in the multiprotein cytochrome P450 2B4-containing system. Proteomics, 2004, 4, 2390-2396.
  2. Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Ипатова О.М. Нанобиотехнология в протеомике и медицине. Сборник материалов ХIV (LXXVII) сессии общего собрания Российской академии медицинских наук, посвященной 60-летию Академии медицинских наук. Научные основы охраны здоровья детей. 2004, 56-62.
  3. Shumyantseva V.V., Ivanov Yu.D., Bistolas N., Scheller F.W., Archakov A.I., Wollenberger U. Direct electron transfer of cytochrome P450 2B4 at electrodes modified withnon-ionic detergent and colloidal clay nanoparticles. Analytical Chemistry, 2004, 76, 6046-6052.

2003

  1. Арчаков А.И., Иванов Ю.Д., Говорун В.М., Учайкин В.Ф., Николаева Л.И., Гнеденко О.В., Константинова Н.И., Ковалев А.В., Конев В.А. Разработка новых методов диагностики гепатитов В и С. Аллергия, астма и иммунология, 2003, 9, 175-178.
  2. Иванов Ю.Д., Гнеденко О.В., Николаева Л.И., Конев В.А., Ковалев О.Б., Учайкин В.Ф., Говорун В.М., Покровский В.И., Арчаков А.И. Определение поверхностного антигена вируса гепатита В с помощью оптического биосенсора. Журн. микробиол., 2003, 2, 58-62.
  3. Archakov A.I., Govorun V.M., Dubanov A.V., Ivanov Yu.D., Veselovsky A.V., Lewi P., Janssen P. Protein-protein interactions as a target for drugs in proteomics. Proteomics, 2003, 3, 380-391.
  4. Momynaliev K.T., Govorun V.M., Gnedenko O., Ivanov Yu.D., Archakov A.I. The use of the resonant mirror biosensor to detect point mutations, as demonstrated with synthetic oligonucleotides. J. of Mol Recognition, 2003, 16, 1-8.
  5. Бунеева О.А., Гнеденко О.В., Панова Н.Г., Медведева М.В., Иванов Ю.Д., Медведев А.Е. Глицерол-3-фосфатдегидрогеназа-изатин-связывающий белок цитозоля. Биомедицинская химия, 2003, 49, 6, 627-631.

2002

  1. Kuznetsov V.Yu., Ivanov Yu.D., Bykov V.A., Saunin S.A., Fedorov I.A., Lemeshko S.V., Hui Bon Hoa and Archakov A.I. Atomic force microscopy detection of molecular complexes in multiprotein P450cam-containing monooxygenase system. Proteomics, 2002, 2, 1699-1705.
  2. Иванов Ю.Д., Панова Н.Г., Гнеденко О.В., Бунеева О.А., Медведев А.Е., Арчаков А.И. Исследование тканевого и субклеточного распределения изатин-связывающих белков при помощи оптического биосенсора. Вопросы мед. химии, 2002, 48, 1, 73-83.
  3. Дмитриев Д.А., Массино Ю.С., Сегал О.Л., Смирнова М.Б., Павлова Е.В., Коляскина Г.И., Гуревич К.Г., Гнеденко О.В., Иванов Ю.Д., Арчаков А.И., Осипов А.П., Дмитриев А.Д., Егоров А.М. Анализ связывания биспецифических моноклональных антител с иммобилизованными антигенами с помощью оптического биосенсора. Биохимия, 2002, 67, 12, 1643-1654.
  4. Dmitriev D.A., Massino Y.S., Segal O.L., Smirnova M.B., Pavlova E.V., Gurevich K.G., Gnedenko O.V., Ivanov Y.D., Kolyaskina G.I., Archakov A.I., Osipov A.P., Dmitriev A.D., Egorov A.M. Analysis of the binding of bispecific monoclonal antibodies with immobilized antigens (human IgG and horseradish peroxidase) using a resonant mirror biosensor. J Immunol Methods, 2002, 261, 103-118.
  5. Archakov A.I., Ivanov Y.D. Optical biosensor and scanning probe microscopy studies of cytochrome P450 interactions with redox partners and phospholipid layers. Methods in Enzymology, 2002, 357, 94-103.
  6. Veselovsky A.V., Ivanov Yu.D., Ivanov A.S., Archakov A.I., Lewi P., Janssen P. Protein-protein interactions: mechanisms and modification by drugs. J. of Mol. Recognition, 2002, 15, 405-422.

2001

  1. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Karuzina I.P., Archakov A.I., Hui Bon Hoa G., Sligar S.G. Molecular recognition in the P450cam Monooxygenase System: direct monitoring of Protein-Protein Interaction by using optical biosensor. Arch. Biochem. Biophys, 2001, 391, 255-264.
  2. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Karyzina I.I., Usanov S.A., Hui Bon Hoa G., Sligar S.G. and Archakov A. I. Revelation of ternary complexes between redox partners in cytochrome P450-containing monooxygenase systems by the optical biosensor method. J. of Inorg. Biochem. 2001, 87, 175-184.
  3. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Gnedenko O.V., Pozdnev V.F., Shumyantseva V.V., Samenkova N.F., Kuznetsova G.P., Tereza A.M., Schmid R.D., Archakov A.I. Optical Biosensor investigation of interactions of biomembrane and water–soluble cytochromes P450 and their redox partners with covalently immobilized phosphatidylethanolamine layers. J. Molec. Recognition, 2001, 14, 185-196.
  4. Семенова Н.В., Иванов Ю.Д., Гнеденко О.В., Конев В.А., Ковалев О.Б., Учайкин В.Ф., Морозов С.Г., Арчаков А.И. Диагностика инфекционных заболеваний с помощью оптического биосенсора. Выявление поверхностного антигена вируса гепатита В (HBsAg) методом оптического биосенсора. Новости науки и техники. Аллергия, астма и клиническая иммунология. 2001, 1, 183-185.
  5. Иванов Ю.Д., Гнеденко О.В., Конев В.А., Ковалев О.Б., Николаева Л.И., Семенова Н.В., Учайкин В.Ф., Арчаков А.И. Детекция поверхностного антигена вируса гепатита В с помощью оптического биосенсора. Вопросы мед. химии, 2001, 47, 4, 419-425.

2000

  1. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P. and Archakov A.I. Optical biosensor study of ternary complex formation in a cytochrome P450 2B4 system. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2000, 273, 750-752.

1999

  1. Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Kuznetsov V.Yu., Lehnerer M., Schulze J., Hlavica P., and Archakov A. I. The optical biosensor studies on the role of hydrophobic tails of NADPH-cytochrome P450 reductase and cytochromes P450 2B4 and b5 upon productive complex formation within a monomeric reconstituted system. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 362, 1, 87-93.
  2. Ivanov Yu.D., Usanov S.A. and Archakov A.I. Optical biosensor studies on the productive complex formation between the components of cytochrome P450scc dependent monooxygenase system. Biochemistry and Molecular Biology International. 1999, 47, 2, 327-336.
  3. Koudinov A.R., Koudinova N.V., Berezov T.T., Ivanov Y.D. HDL phospholipid: a natural inhibitor of Alzheimer’s amyloid beta-fibrillogenesis? Clin Chem Lab Med. 1999, 37 (9), 993-994.
  4. Koval V.V., Gnedenko O.V., Ivanov Yu.D., Fedorova O.S., Archakov A.I., Knorre D.G. Real — time oligonucleotide hybridization kinetics monitored by resonant mirror technique. IUBMB LIFE, 1999, 48, 317-320.
  5. Kiselyova O.I., Yaminsky I.V., Ivanov Yu.D., Kanaeva I.P., Kuznetsov V.Yu., Archakov A.I. AFM study of membrane proteins, cytochrome P450 2B4 and NADPH-cytochrome P450 reductase, and of their complex formation. Archives of Biochemistry and Biophysics, 1999, 371, 1, 1-7.
  6. Морозов С.Г., Иванов Ю.Д., Учайкин В.Ф., Каражас Н.В., Вахрушина С.В., Гнеденко О.В., Конев В.А., Ковалев О.Б., Арчаков А.И. Диагностика Цитомегаловирусной инфекции с помощью оптического биосенсора. Аллергия, астма и клиническая иммунология, 1999, 9, 187-189.

1998

  1. Archakov A.I. and Ivanov Yu.D. The optical biosensor study of protein-protein interactions within cytochromes P450 containing mononoxygenase systems. In Book Biophysics of Electron Transfer and Molecular Bioelectronics. Plenum Press, USA, 1998, 173-196.

1997

  1. Ivanov Yu. D., Kanaeva I.P., Eldarov M.A., Skryabin K.G., Lehnerer M., Schulze J., Hlavica P., and Archakov A.I. An optical biosensor study of the parameters and role of hydrophobic tails of cytochrome P450 cytochromes.P4502B4, b5 and NADPH-flavoprotein in complex. Biochemistry and Molecular Biology International. 1997, 42, 4, 731-737.

1995

  1. Shumyantseva V.V., Meshkov S.V., Ivanov Yu. D., Alexsandrova O.V., Uvarov V. Yu. and Archakov A.I. Interaction of organophosphorus analogues of amino acids whith P 450. Xenobiotica, 1995, 25, 3, 219-227.

1993

  1. Ivanov Yu.D., Makarov S.G. and Uvarov V.Yu. Resolution of overlapped spectral bands by the Monte Carlo metod. Vibrational Spectroscopy,1993, 5, 175-179.

Патенты

  1. Патент N 2315999 от 27 01 2008 бюллетень № 3 Арчаков А.И., Говорун В.М., Гнеденко А.И. Иванов Ю.Д. и др. Нанодиагностическая тест – система для выявления вирусов гепатитов.
  2. Пат. 2283496 Российская Федерация, МПК G01N33/53, G01N13/10. Способ регистрации макромолекул при проведении протеомных исследований и биочип, используемый при их регистрации [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Говорун В. М., Быков В. А., Светлов С. К., Позднеев В. Ф.,Зиборов В. С.,Кирпичников М. П.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2004119864/15; заявл. 30.06.2004; опубл. 10.01.2006
  3. Пат. 2338199 Российская Федерация, МПК G01N33/543. Способ регистрацииспецифических макромолекул в биологической пробе и устройство для его осуществления [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т.О., Светлов С. К., Крохин Н. В., Быков В. А.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2006124680/15; заявл. 11.07.2006; опубл. 20.01.2008
  4. Пат. 2351932 Российская Федерация, МПК G01N33/53. Способ регистрации и идентификации макромолекул при помощи сопряженной системы на основе сканирующей пробной микроскопии и масс-спектрометрии [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т. О., Торопыгин И. Ю., Згода В. Г., Быков В. А.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2006129865/15; заявл. 18.08.2006; опубл. 27.02.2008
  5. Пат. 2361215 Российская Федерация, МПК G01N33/53. Диагностическая тест-система для выцявления заболевания [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Быков В. А.; заявители и патентообладатели Арчаков А.И. (RU), Иванов Ю. Д. (RU). № 2007141809/15; заявл. 14.11.2007; опубл. 14.11.2007
  6. Пат. 2362169 Российская Федерация, МПК G01N33/543.Нанобиочип, используемый для регистрации белков и белковых комплексов, способ его получения и способ регистрации белков и белковых комплексов с использованием зондовой микроскопии, [Текст] / Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т.О., Светлов С. К., Быков В. А., Зиборов В. С.; заявитель и патентообладатель Арчаков А.И. (RU). № 2007117787/15; заявл. 14.05.2007; опубл. 20.11.2008
  7. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2013614266 Российская Федерация. Программное обеспечение НАНОБИОСЕНСОР (ПО НБС) / Авторы: Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Крохин Н. В., Козлов А. Ф.; патентообладатель: Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н.Ореховича» Российской академии медицинских наук. Заявка № 2013610110, дата поступл. 10.01.2013, зарегистрирована в реестре программ для ЭВМ 26.04.2013
  8. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2010613458 Российская Федерация. Программное обеспечение обработки данных АСМ (ПО одАСМ) / Авторы: Крохин Н. В., Арчаков А. И., Иванов Ю. Д., Плешакова Т. О., Бухарина Н. С.; правообладатель: Крохин Николай Валентинович. Заявка № 2010611728, дата поступл. 06.04.2010, зарегистрирована в реестре программ для ЭВМ 26.05.2010

Партнеры

ПАРТНЕРЫ

  • Dr. Gaston Hui Bon Hoa, INSERM, Paris, France.
  • Prof. R. Bernhardt, Institute of Biochemistry Saarland University, Saarbrucken, Germany.
  • Проф. Усанов С.А., Институт биоорганической химии, Минск, Беларусь.
  • Институт физики полупроводников СО РАН (ИФП СО РАН), Новосибирск
    ИФП СО РАН является исследовательским центром с широким фронтом деятельности в области современной физики полупроводников, физики конденсированного состояния, в развитии научных основ технологий полупроводниковой микро-, опто-, нано- и акустоэлектроники, информационных технологий и квантовой электроники.
  • НТ-МДТ
    Специализируется на создании прецизионной нанотехники, в том числе производит устройства сопряжения АСМ с рамановскими спектрометрами, с масс-спектрометрами и т.д. Производственная база и инженерные кадры НТ-МДТ позволяют на должном уровне провести необходимые конструкторские разработки. НТ-МДТ является признанным лидером на отечественном рынке по производству сканирующих зондовых микроскопов (СЗМ), в том числе АСМ.
  • Interlab Inc. (Agilent Technologies)
    Одна из наиболее динамичных и быстро развивающихся компаний на рынке аналитического оборудования, поддерживающая крупные государственные программы в области здравоохранения.